Vaga de Analista de Processos

Cidacs está com vaga(s) de emprego para bioinformata pleno para salvador em salvador / ba cargo: bioinformata pleno salvador cidacs requisito: o cidacs conduz estudos e pesquisas baseados em projetos interdisciplinares originados na vinculação de grandes volumes de dados para ampliar o entendimento dos determinantes e das políticas sociais e ambientais sobre a saúde da população. Qualificações e requisitos obrigatórios : formação : mestrado em bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica humana. experiência : mínimoem bioinformática (acadêmica ou profissional), com atuação comprovada em genômica. experiência sólida no desenho, implementação, operação e otimização de pipelines reprodutíveis (pré-Processamento, mapeamento, chamadas de variantes, joint-Genotyping etc.). Participação prévia como bioinformata em projetos de genômica. Habilidade técnicas : experiência prática com nextflow e / ou wdl / cromwell, incluindo execução em ambientes hpc. Domínio de ferramentas essenciais : gatk, bwa, samtools / bcftools, picard. Uso de ontologias biomédicas (hpo, snomed, omop) ou experiência em mapeamento de metadados clínicos. experiência com containers (docker, singularity / apptainer). Vivência em qc e curadoria de dados genômicos. Conhecimento de ambientes hpc (slurm, filas, quotas, logs, storage distribuído). Sólida experiência em linux e shell script. experiência com git, versionamento, ci / cd e boas práticas de engenharia de software. Habilidade interpessoais : abordagem analítica e orientada à solução de problemas. Capacidade de trabalhar em ambiente colaborativo e de alta responsabilidade científica. Desejáveis, mas não obrigatórios : outras qualificações : experiência com padrões ga4gh (htsget, refget, duo, phenopackets). experiência no uso de ferramentas e estrutura de dados para registro de dados fenotípicos como redcap. Familiaridade com modelos de dados clínicos, especialmente omop-Cdm. Inglês intermediário diferenciais : doutorado em bioinformática ou áreas correlatas. Publicações científicas relevantes em genômica ou bioinformática. experiência prévia em projetos nacionais ou multicêntricos de grande escala. experiência com pipelines nf-Core, hail ou spark genômico. Conhecimento de processamento em gpu e nvidia parabricks em genômica. Tarefas principais : desenho e implementação de pipelines de bioinformática : projetar pipelines reprodutíveis (pré-Processamento, alinhamento, chamadas de variantes, gvcf, joint-Calling) utilizando containers e seguindo melhores práticas internacionais (gatk best practices, nf-Core). Definir painéis / métricas de qc : estabelecer métricas de qualidade para sequências (fastq / bam / vcf) e metadados clínico-Fenotípicos, definindo thresholds, alertas e relatórios. Automatização : desenvolver rotinas automatizadas para ingestão, auditoria e curadoria, garantindo eficiência, padronização e rastreabilidade. Consolidar catálogos e metadados : apoiar a construção de catálogos agregados de variantes (frequências populacionais), indexação e versionamento de metadados conforme ontologias reconhecidas (hpo, snomed-Ct, omop, ga4gh). Procedimentos operacionais padrão (sops) : elaborar documentos técnicos, guias e templates para garantir governança, auditoria e reprodutibilidade dos processos. Documentação robusta : criar e manter documentação completa e clara, garantindo que pipelines e procedimentos possam ser mantidos, auditados e evoluídos pela equipe no futuro. #j-18808-Ljbffr salário: a combinar benefícios: não foi informado.